Reproducible Research in Computational Ecology: Docker

L’objectif de cet exercice est de vous familiariser avec l’utilisation de Docker, et plus particulièrement avec la création d’un Dockerfile.

Consignes

Nous allons ajouter un Dockerfile au research compendium créé lors de l’exercice 5.

Utilisez la fonction rcompendium::add_dockerfile() (désactivez temporairement renv avec renv::deactivate() le temps d’utiliser cette fonction, puis réactivez-le avec renv::activate())
Réfléchissez si la version de l’image de base rocker/rstudio:4.2.2 est la plus appropriée à votre projet
Regardez le contenu du README.Rmd (doit-il être transpilé ?)
Si vous avez d’installé, suivez les instructions du README.Rmd pour construire votre image, démarrez un conteneur et relancer les analyses.

Pensez aux commits !

Corrections

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Reuse

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